MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Carnobacterium sp. WN1359 plasmid pWNCR12

Total Repeats: 221

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022601	CAA	2	6	66	71	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554639097
2	NC_022601	GCA	2	6	84	89	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554639097
3	NC_022601	GTT	2	6	93	98	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	554639097
4	NC_022601	TTA	2	6	375	380	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554639097
5	NC_022601	A	7	7	446	452	100 %	0 %	0 %	0 %	554639097
6	NC_022601	ACG	2	6	456	461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554639097
7	NC_022601	AGA	2	6	493	498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554639097
8	NC_022601	A	6	6	528	533	100 %	0 %	0 %	0 %	554639097
9	NC_022601	A	6	6	582	587	100 %	0 %	0 %	0 %	554639097
10	NC_022601	CAAA	2	8	598	605	75 %	0 %	0 %	25 %	554639097
11	NC_022601	A	6	6	707	712	100 %	0 %	0 %	0 %	554639097
12	NC_022601	A	6	6	722	727	100 %	0 %	0 %	0 %	554639097
13	NC_022601	CAT	2	6	754	759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554639097
14	NC_022601	GA	3	6	770	775	50 %	0 %	50 %	0 %	554639097
15	NC_022601	CAA	2	6	786	791	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554639097
16	NC_022601	CAA	2	6	810	815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554639097
17	NC_022601	GCA	2	6	845	850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554639097
18	NC_022601	AAC	2	6	933	938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554639097
19	NC_022601	CA	3	6	1010	1015	50 %	0 %	0 %	50 %	554639097
20	NC_022601	AAC	2	6	1143	1148	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554639097
21	NC_022601	AAACC	2	10	1166	1175	60 %	0 %	0 %	40 %	554639097
22	NC_022601	ACA	2	6	2010	2015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554639098
23	NC_022601	ATGA	2	8	2021	2028	50 %	25 %	25 %	0 %	554639098
24	NC_022601	ATT	2	6	2151	2156	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554639098
25	NC_022601	TAA	2	6	2284	2289	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554639098
26	NC_022601	A	7	7	2292	2298	100 %	0 %	0 %	0 %	554639098
27	NC_022601	AACT	2	8	2353	2360	50 %	25 %	0 %	25 %	554639098
28	NC_022601	AAG	2	6	2395	2400	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554639098
29	NC_022601	AGA	2	6	2592	2597	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554639098
30	NC_022601	A	9	9	2597	2605	100 %	0 %	0 %	0 %	554639098
31	NC_022601	GTG	2	6	2616	2621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	554639098
32	NC_022601	AATTT	2	10	2640	2649	40 %	60 %	0 %	0 %	554639098
33	NC_022601	CCT	2	6	2663	2668	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	554639098
34	NC_022601	AAT	2	6	2706	2711	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554639098
35	NC_022601	AGA	2	6	2825	2830	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554639112
36	NC_022601	AGC	2	6	2831	2836	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554639112
37	NC_022601	A	6	6	2838	2843	100 %	0 %	0 %	0 %	554639112
38	NC_022601	TGAT	2	8	2884	2891	25 %	50 %	25 %	0 %	554639112
39	NC_022601	GAT	2	6	2925	2930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554639112
40	NC_022601	TA	3	6	2944	2949	50 %	50 %	0 %	0 %	554639112
41	NC_022601	ATA	2	6	2956	2961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554639112
42	NC_022601	AAC	2	6	2963	2968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554639112
43	NC_022601	ATCA	2	8	2970	2977	50 %	25 %	0 %	25 %	554639112
44	NC_022601	ATT	2	6	2979	2984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554639112
45	NC_022601	TAA	3	9	3089	3097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554639112
46	NC_022601	GTTA	2	8	3122	3129	25 %	50 %	25 %	0 %	554639112
47	NC_022601	A	8	8	3148	3155	100 %	0 %	0 %	0 %	554639112
48	NC_022601	ATT	2	6	3164	3169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554639112
49	NC_022601	AAT	2	6	3185	3190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554639112
50	NC_022601	ATG	2	6	3279	3284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554639112
51	NC_022601	A	6	6	3312	3317	100 %	0 %	0 %	0 %	554639112
52	NC_022601	GAA	2	6	3318	3323	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554639112
53	NC_022601	T	6	6	3360	3365	0 %	100 %	0 %	0 %	554639112
54	NC_022601	A	6	6	3378	3383	100 %	0 %	0 %	0 %	554639112
55	NC_022601	TAGAT	2	10	3481	3490	40 %	40 %	20 %	0 %	554639099
56	NC_022601	TA	3	6	3514	3519	50 %	50 %	0 %	0 %	554639099
57	NC_022601	A	6	6	3558	3563	100 %	0 %	0 %	0 %	554639099
58	NC_022601	CAG	2	6	3586	3591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554639099
59	NC_022601	AAC	2	6	3604	3609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554639099
60	NC_022601	TTC	2	6	3734	3739	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554639099
61	NC_022601	AAC	2	6	3742	3747	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554639099
62	NC_022601	CAAT	2	8	3757	3764	50 %	25 %	0 %	25 %	554639099
63	NC_022601	ATC	2	6	3818	3823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554639099
64	NC_022601	GCT	2	6	4108	4113	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	554639100
65	NC_022601	GTGC	2	8	4192	4199	0 %	25 %	50 %	25 %	554639100
66	NC_022601	ACC	2	6	4270	4275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	554639100
67	NC_022601	AAT	2	6	4293	4298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554639100
68	NC_022601	T	7	7	4377	4383	0 %	100 %	0 %	0 %	554639100
69	NC_022601	GAA	2	6	4406	4411	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554639100
70	NC_022601	TTTAA	2	10	4427	4436	40 %	60 %	0 %	0 %	554639100
71	NC_022601	A	6	6	4526	4531	100 %	0 %	0 %	0 %	554639100
72	NC_022601	TTG	2	6	4543	4548	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	554639100
73	NC_022601	ATG	2	6	4814	4819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554639101
74	NC_022601	A	8	8	4825	4832	100 %	0 %	0 %	0 %	554639101
75	NC_022601	TC	3	6	4833	4838	0 %	50 %	0 %	50 %	554639101
76	NC_022601	TCA	2	6	4883	4888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554639101
77	NC_022601	CAG	2	6	4902	4907	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554639101
78	NC_022601	CA	3	6	4933	4938	50 %	0 %	0 %	50 %	554639101
79	NC_022601	AGT	2	6	4964	4969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554639101
80	NC_022601	AGT	2	6	4991	4996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554639101
81	NC_022601	GAA	2	6	5006	5011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554639101
82	NC_022601	AGA	2	6	5023	5028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554639101
83	NC_022601	TCT	3	9	5039	5047	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554639101
84	NC_022601	ATCT	2	8	5073	5080	25 %	50 %	0 %	25 %	554639101
85	NC_022601	CTG	2	6	5133	5138	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	554639101
86	NC_022601	TTC	2	6	5140	5145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554639101
87	NC_022601	ATTA	2	8	5192	5199	50 %	50 %	0 %	0 %	554639101
88	NC_022601	GAT	2	6	5204	5209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554639101
89	NC_022601	AGA	2	6	5266	5271	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554639101
90	NC_022601	GGA	2	6	5311	5316	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	554639101
91	NC_022601	GGT	2	6	5318	5323	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	554639101
92	NC_022601	CA	3	6	5374	5379	50 %	0 %	0 %	50 %	554639101
93	NC_022601	GAA	2	6	5390	5395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554639101
94	NC_022601	A	8	8	5458	5465	100 %	0 %	0 %	0 %	554639101
95	NC_022601	AGA	2	6	5479	5484	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554639101
96	NC_022601	AGT	2	6	5515	5520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554639101
97	NC_022601	ACA	2	6	5603	5608	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	554639101
98	NC_022601	ACC	2	6	5743	5748	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	554639102
99	NC_022601	AAT	2	6	5804	5809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554639102
100	NC_022601	AAT	2	6	5878	5883	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554639102
101	NC_022601	TA	3	6	5936	5941	50 %	50 %	0 %	0 %	554639102
102	NC_022601	AGA	2	6	6008	6013	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554639102
103	NC_022601	AGC	2	6	6092	6097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	554639102
104	NC_022601	AAG	2	6	6121	6126	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554639102
105	NC_022601	AAT	2	6	6291	6296	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554639103
106	NC_022601	AG	3	6	6328	6333	50 %	0 %	50 %	0 %	554639103
107	NC_022601	CTT	2	6	6337	6342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554639103
108	NC_022601	TA	3	6	6355	6360	50 %	50 %	0 %	0 %	554639103
109	NC_022601	TCAA	2	8	6456	6463	50 %	25 %	0 %	25 %	554639103
110	NC_022601	ATT	2	6	6464	6469	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	554639103
111	NC_022601	TCA	2	6	6579	6584	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	554639103
112	NC_022601	GCT	2	6	6618	6623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	554639103
113	NC_022601	TG	3	6	6624	6629	0 %	50 %	50 %	0 %	554639103
114	NC_022601	T	6	6	6635	6640	0 %	100 %	0 %	0 %	554639103
115	NC_022601	AAT	2	6	6691	6696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554639103
116	NC_022601	T	6	6	6752	6757	0 %	100 %	0 %	0 %	554639103
117	NC_022601	TTTTTC	2	12	6759	6770	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	554639103
118	NC_022601	AGT	2	6	6783	6788	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554639103
119	NC_022601	TCG	2	6	6817	6822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	554639103
120	NC_022601	TAG	2	6	6894	6899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554639103
121	NC_022601	AAT	2	6	6911	6916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554639103
122	NC_022601	CTG	2	6	6923	6928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	554639103
123	NC_022601	CTT	2	6	7380	7385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554639104
124	NC_022601	AGG	2	6	7397	7402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	554639104
125	NC_022601	AATCG	2	10	7473	7482	40 %	20 %	20 %	20 %	554639104
126	NC_022601	CCA	2	6	7491	7496	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	554639104
127	NC_022601	CAC	2	6	7618	7623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	554639104
128	NC_022601	TGA	3	9	7632	7640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554639104
129	NC_022601	AGA	2	6	7641	7646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	554639104
130	NC_022601	TCC	2	6	7653	7658	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	554639104
131	NC_022601	GGC	2	6	7675	7680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	554639104
132	NC_022601	GTA	2	6	7696	7701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	554639104
133	NC_022601	A	6	6	7707	7712	100 %	0 %	0 %	0 %	554639104
134	NC_022601	AGTA	2	8	7805	7812	50 %	25 %	25 %	0 %	554639104
135	NC_022601	AAT	2	6	7991	7996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	554639105
136	NC_022601	AG	3	6	8028	8033	50 %	0 %	50 %	0 %	554639105
137	NC_022601	CTT	2	6	8037	8042	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	554639105
138	NC_022601	TA	3	6	8055	8060	50 %	50 %	0 %	0 %	554639105
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.